Сезон 1

Черепашки впервые обнаруживают, что они не самые странные существа в Нью-Йорке, когда сталкиваются с двумя злодеями из Скрытого города, преследующими агента, похожего на кота. Они впервые сталкиваются с бароном Драксумом, который создает мутантов с помощью своих Оозескитос.

Донни создает новое снаряжение для своих братьев, чтобы они могли преодолеть свои плохие привычки. Однако снаряжение становится лишь помехой, когда они сражаются с мутировавшим шеф-поваром по прозвищу Мясной Пот, который планирует приготовить черепах, чтобы получить их силы.

Чтобы спасти Эйприл работу капитана вечеринки в пиццерии Альбеарто, Донни модернизирует главного аниматроника Альбеарто, но тот выходит из-под контроля.

Сплинтер заболел крысиным гриппом, и Черепашкам предстоит справиться с 7 различными стадиями, включая лихорадку, «Дикий крысиный человек», «Пирожные «Капитан Каддл»», «Верховный ниндзя», песни о любви в караоке и фанфики. Черепашки надеются, что Сплинтер доберется до финальной стадии под названием «Должен сказать «да»», ​​чтобы они могли попросить его о чем угодно.

Лео лишает кумира Рафа по рестлингу Призрачного Медведя титула чемпиона мира, случайно упав на него со стропил. Раф вскоре начинает раздражаться из-за самонадеянности Лео и решает сам сразиться с ним. Когда Призрачный Медведь присоединяется к борьбе, Раф узнаёт, что Призрачный Медведь не играет по правилам.

Майки и Донни пытаются получить лунный багги Юпитера Джима со склада репо, где сталкиваются с его владельцем Репо Мантисом. В обмен на пропеллерный автомобиль Майки и Донни нанимаются в качестве репоменщиков и отправляются конфисковать автофургон на Лонг-Айленде. Однако сделка ухудшается, когда они встречают владельца автофургона, доброго мутанта по имени Тодд Капибара, и его щенков.

Когда недавно построенный Черепаший танк Донни пропадает, он и Черепашки должны найти его. Преследуя некоторых обычных подозреваемых, они не знают, что Черепаший танк был украден Сплинтером, которого дополнительно пригласили на «ужин» с Мясным Потом.

Желая острых ощущений от жизни героя, Лео уговаривает команду выследить дуэт бумажных воров, которые в настоящее время бродят по городу. При этом Черепашки сталкиваются с кланом Фут, которые используют свои мистические способности, чтобы создавать воинов-оригами из украденной бумаги.

В поисках подарков для Сплинтера Черепашки пересекают Таймс-сквер, где сражаются с таящимися там бандитскими талисманами.

Чтобы доказать, что он является злейшим врагом Черепашек, бывший ведущий новостей, ставший мутантом-червем, Уоррен Стоун встает на пути Черепашек, когда они выслеживают Гипно-Потамуса, похищающего животных-партнеров других фокусников.

После того, как Черепашки натыкаются на пиццерию в мистическом Подгороде, преследуя Огненного Ёкая, Леонардо тащит своих братьев в Лабиринт Смерти в форме пиццы, чтобы получить главный приз... бесплатную порцию "лучшей в мире пиццы" в титульном зале. Но чтобы получить его, им придется сразиться с хранителем пиццы в облике Минотавра, который является помощником управляющего лабиринтом.

«Черепашки» с трудом наблюдают за своим кумиром-скейтбордистом Сидни Алленом в финале «Экстремального скейтбординга» и одновременно предотвращают ограбление универмага Гилберта, совершенное кланом Фут.

Лео, Майки и Эйприл расследуют таинственное привидение, обитающее в тематическом супермаркете Сток-н-шоп, что приводит их к встрече с Бакстером Стокбоем.

Эйприл и братья заставляют Рафа столкнуться с его самым большим страхом: очаровательным кроликом из детского телешоу по имени Миссис Каддлс. Однако все становится не таким уж смешным, когда Миссис Каддлс внезапно оживает и начинает охотиться на семью Черепах, чтобы питаться их страхами.

Гипно-Потамус возвращается и устраивает хаос на выпускном балу Эйприл, загипнотизировав присутствующих.

После неудачного инцидента со склеиванием Черепашкам приходится сражаться с целой армией злодеев, среди которых Мутант Серебряная Рыба, Клан Фут, Гипно-Потамус и Уоррен Стоун, при этом они буквально склеены вместе.

Черепахи ищут способ устранить проблему слизнекомаров в Нью-Йорке.

Черепашки планируют свой первый публичный музыкальный концерт в Земля Альбеарто. Когда он состоится, его разрушит Альбеарто и его армия аниматронных медведей из провалившихся франшиз фастфуда Альбеарто.

Черепашки сталкиваются с новой и опасной угрозой в своем любимом городе, когда барон Драксум, Хугинн и Мунинн собирают своих самых сильных врагов-мутантов, таких как Мясной Пот, Гипно-Потамус, Уоррен Стоун, Репо Мантис и братья Сандо, чтобы составить заговор с целью их уничтожения.

Во время визита в школу Эйприл Донателло влюбляется в эксклюзивный технический клуб, Фиолетовые Драконы, и тут же присоединяется к ним. Однако, когда Драконы злоупотребляют его технологиями в преступных целях, Донателло вынужден выбирать между тем, чтобы остановить мошенников и потерять свою драгоценную фиолетовую куртку члена.

ДИГГ, трио неудачливых девушек-музыкантов, мутировавших в роющих животных, начинают топить любимые пиццерии Черепашек, побуждая Черепашек отправиться за ними, пока у них не осталось места, где можно было бы достать свою любимую еду.

Чтобы облегчить им домашние дела, Донателло изобретает новый искусственный интеллект, Ш.Э.Л.Д.О.Н., который начинает заботиться исключительно о нуждах своего создателя. Недовольные Рафаэль, Микеланджело и Леонардо решают перемонтировать робота, что приводит к почти фатальным последствиям для их брата.

Майки отправляется на одиночную миссию, чтобы вернуть классическую видеоигру, основанную на фильме Лу Джитсу «Горячий суп». Однако, попутно, ему придется сразиться с новым рекрутом клана Фут, который находится на очень похожей миссии в том же самом аукционном доме. Примечание: Мороженое Китти из предыдущей серии появляется в качестве камео в виде статуи.

Простая задача вернуть один-единственный ДВД-диск до истечения срока его аренды осложняется бесконечным безумием в Нью-Йорке, включая встречу с Призрачным Медведем.

Дела идут плохо, когда Черепашки пытаются помочь нищему мутанту в виде коридорного, ставшего мутантом быка из "Истребители ошибок", и в то же время планируют набег, чтобы получить больше паутины Биг Мамы. Буллхоп с радостью решает помочь своим благодетелям.

Разочарованный ребячеством своих братьев во время важной миссии, Донателло повышает их интеллект. Однако все быстро выходит из-под контроля, когда они начинают проявлять черты характера Донателло.

Когда Микеланджело и Капибара Тодда шпионят за Мит Суэтсом, чтобы узнать его самый вкусный рецепт, Черепаха и мутант-повар становятся лучшими друзьями после того, как Мит Суэтс случайно впитывает любезность Тодда. Они вдвоем отправляются на поиски чрезвычайно редкого лунного трюфеля, который растет только тогда, когда Луна находится в выравнивании с Юпитером, и сталкиваются с его хранителем — Деревом-оборотнем.

Лео теряет своих братьев в портале и должен отправиться в мистический Скрытый Город, чтобы спасти их. Он обнаруживает, что они находятся на пиратском корабле под управлением Капитана Пиеля.

Раф становится другом нового спарринг-партнера в лице Франкенфута и должен скрывать это от своих братьев, которым этот парень не нравится. Когда Франкенфута выгоняют из логова, это дает Лейтенанту Фут и Рекруту Фут возможность принять его в клан Фут.

Пока Черепашки пытаются найти части странного металла, который ищет Барон Драксум, Сплинтер намеревается докопаться до сути странных событий на новой работе Эйприл в Хижина для ног. Вскоре он узнает, что Foot планируют воскресить своего древнего хозяина Шреддера, собрав заново доспехи Черная броня. Когда стороны сталкиваются, тайны прошлого Сплинтера наконец выходят на свет.

Барон Драксум, Хугинн и Мунинн хотят перчатку, которая есть у Уоррена Стоуна, поскольку она является частью доспехов Курои Ёрои, но он не отдаст ее без борьбы и предательства. Когда Черепашки ввязываются в ситуацию, когда сосед Уоррена по комнате Гипно-Потамус подвергается угрозам, Эйприл вспоминает, кто такой Уоррен Стоун, поскольку она была частью фан-клуба, посвященного ему, под названием «Камнеголовые».

Лео и Донни отчаянно пытаются помочь Эйприл насладиться тихим днём с новой подругой по имени Сунита. Они узнают, что она слизь Ёкай, которая использует специальный амулет, чтобы превращаться в человека. Вскоре они становятся мишенью клана Фут, поскольку ботинки, которые носит человеческая форма Суниты, являются частью Курои Ёрои.

Сеньор Уэсо только что вспомнил, что банда огров под названием «Творцы жестокости» и банда рептилий под названием «Творцы варварства» забронировали столики в Пицца повседневного спроса. Помогая сеньору Уэсо в Пицца повседневного спроса, поскольку его сотрудники сбежали, Лео и Майки отвлекаются на братское соперничество. Они должны преодолеть это, чтобы сохранить мир, и при этом не разрушить Пицца повседневного спроса.

Барон Драксум изо всех сил пытается продвинуться по карьерной лестнице в клане Фут, в то время как Фут Рекрут был недоволен тем, что она еще не получила свою отметку. Найдя лазейку, в которой член клана Фут, который может превзойти действующего лидера, может занять эту должность, барон Драксум побуждает Фут Рекрута организовать грубую ошибку для Фут Лейтенанта и Фут Брута, когда следующий фрагмент Курои Ёрой находится в ботаническом саду. Тем временем Черепахи проводят соревнование, чтобы увидеть, кто сможет выдержать запах трупного цветка в том же ботаническом саду.

Черепашки погружаются в глубины таинственной скрытой библиотеки в поисках способа спасти Мэйхема из зеркала Эйприл. Стараясь быть тихими, они также должны избегать того, чтобы их не услышали Молчаливые летучие мыши Бэт-библиотекаря, и сразиться с Лейтенант пешего пехотинца и пехотный зверь.

Когда в Нью-Йорке появляется новая конкурентоспособная видеоигра, Донни готов на все, чтобы занять первое место. Хотя Донни и не знает, что видеоигра была создана Фиолетовые Драконы.

Ленивое путешествие Черепашек по канализации превращается в настоящее безумие, когда Раф остается один.

Неудачные попытки Черепашек совершить добрые дела настраивают против них весь Нью-Йорк.

Сплинтер участвует в гонке на выживание в составе Черепаха танк.

Сплинтер обучает своих сыновей искусству маскировки ниндзя.

Черепашки пытаются найти часть Темной брони на свалке Репо Мантиса.

Свирепый мутант пытается испортить Эйприл и Черепашкам веселый день в снегу.

Эйприл и Сунита обыскивают Нью-Йорк в поисках украденной плащевой броши Суниты.

Черепашки встречают своего любимого героя научно-фантастических фильмов Юпитера Джима.

Когда темная броня почти готова, Черепашки решают стать серьезнее и принять свое наследие ниндзя.

Сплинтер и Черепахи должны помешать Барону Драксуму заполучить последнюю часть Курои Ёрои.