Сезон 1

В этой серии зрители знакомятся с добрым доктором Айболитом, который совершенно бесплатно лечит лесных зверей. Очереди к нему огромные, но доктор не жалуется и помогает всем без исключения. Сначала к нему пришла лиса, которую укусила оса, потом пришел Барбос, которого курица клюнула в нос. Но больше всех не повезло зайчонку. Ему трамвай переехал лапки, и доктор Айболит взялся пришить ему новые.

Пока Айболит лечит зверей на одном конце земли, на другом – орудует злой и беспощадный Бармалей. Он ненавидит зверей и детей и поэтому жители его страны сажают его в тюрьму. Однако у злодея есть друзья – такие же разбойники, как и он. И вот именно эти друзья и вызволяют Бармалея из-за решетки...

В третьей серии зрителей знакомят с Варварой – злой сестрой Айболита. Она живет вместе с братом, и не разделяет его любовь к животным. Более того, она просто ненавидит зверей. В какой-то момент ее выводят из себя постоянные телефонные звонки животных, и она решает покинуть Айболита.

Бармалей придумал коварный план, как навредить животным в Африке. Вместе со своими пиратами и Варварой он заманил зверей на свой корабль под предлогом посмотреть фильм-оперу «Муха-цокотуха». Однако пока звери наслаждались представлением, за кулисами для них готовилось «угощение» из малярии, бронхита и других болезней.

Айболит спешит на помощь больным африканским зверям, которых злые пираты посадили в клетки. Но путь до Лимпопо не близкий. Сначала доктору нужно преодолеть бушующее море, а потом отвесные горы. Хорошо, что ему всегда приходят на помощь звери.

Бармалей заставил крокодила проглотить Солнце, чтобы Айболит в темноте сбился с курса. Однако доктор все равно смог прилететь в Лимпопо и сразу же принялся лечить зверей. Но когда последний больной был вылечен перед животными встала другая проблема – нужно было вернуть Солнце на небо.

Бармалей со своими приспешниками пустился бежать. Их последней надеждой был ужасный великан Тараканище. В итоге разбойники не прогадали и самонадеянный и наглый таракан поверг в ужас всех животных, которые во много раз были его больше и сильнее. Но тут на выручку опять пришел Айболит...